医疗器械经营许可证现为后置审批，工商行政管理部门发给营业执照后申请审批。《医疗器械经营企业许可证》有效期为5年。
国家对于医疗器械有着严格的分类，目前经营一类产品是不需要办理医疗器械器经营许可证的，经营二类产品是需要办理二类医疗器械经营备案凭证，经营三类产品才是办理医疗器械经营许可证。
二类医疗器械包括：如体温计、血压计、助昕器、制氧机、避孕套、针灸针、心电诊断仪器、无创监护仪器、光学内窥镜、恒温培养箱、全自动生化分析仪、便携式超声诊断仪、牙科综合治疗仪、医用脱脂纱布、医用脱脂棉等；更加详细的医疗器械分类在网上都可查到。
三类医疗器械：指的是用于植入人体或支持维持生命，对人体具有潜在危险，对其安全性、有效性必须严格控制的医疗器械。如植入式心脏起搏器地、体外震波碎石机、病人有创监护系统等。
办理医疗器械经营许可证的流程
1、现场递交材料
2、窗口工作人员收件，符合要求的确认受理，不符合要求的不予受理
3、材料审核，材料不齐全的要求申办人补齐补正
4、现场验收：需现场验收的转现场验收，无需现场验收的审核通过后转审批
5、审批，符合条件的予以许可，不符合条件的不予许可
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